September 2013

Orthogonalising CSF, WM and 6 motion parameters

 Dear experts,

Can you please tell me if, in DPARSFA, CSF, WM and the 6 motion parameters are orthogonalised against each other before these covariates are regressed out during pre-processing?

Thank you very much for your advice!
Regards, Mamtis

成分筛选

关于独立成分分析还有些地方不明白,在成分提取之后,如何对已提取的成分进行筛选,看文章里面说筛选步骤主要分两步,(1)首先由于背侧注意网络的频带属于低频段(0.01-0.1Hz),分析各个独立成分对应的时间序列的功率谱,如果高频信号(>0.1Hz)占该独立成分的功率谱 50%以上,则去除该成分.功率图谱是怎么看的呢???(2)然后在剩余的成分中用一个模板匹配程序选择与背侧注意网络模板最匹配的成分,该模板匹配程序主要是计算每个成分中落在模板内体素的 z 值的平均值与模板外体素的 z 值的均值之差,定义为拟合度值(goodness-of-fit scores),选择拟合度值最大的成分作为最匹配(best-fit)的成分,即可认为该成分是背侧注意网络。这两步具体是怎么实现的呢??希望能得到大师指点…………

有关FA图与fmri图像的融合问题,求高人解答!!跪谢!!

大家好,我的课题是老年性痴呆的功能磁共振研究,最近向导师汇报科研进度时,他问我能否把弥散张量的FA图与静息态图像进行融合,这样就可以对两者进行综合相关分析,我也查了一些文献,确实有一些研究者将两种图像进行了融合,于是我自己尝试了一下。

我用的磁共振是SIEMENS Trio 3.0T,文献上用的是GE或者飞利浦的磁共振,然后说将FA图进行空间标准化后,利用MRIcro软件将其与fMRI融合,我的理解是把FA序列得DICOM图像进行NORMALIZE后得到的文件叠加在MRIcro的fMRI图像上,然后我用DPARSF basic edition ,导入FA的图像,然后勾选DICOM to NIFTI,Slice timing,Realign,Normalize,然后RUN,结果MATLAB里面提示 说 index exceeds matrix dimension,下面一堆红色的ERROR。

我自己确实不知打如何进行FA和fMRI的融合,这只是一个尝试,希望有相关融合经验的同行、前辈高人指导一下具体的操作步骤。另外,matlab的提示是不是时候DTI扫描参数和fmri不一致?是不是由于不同厂家磁共振扫描的图像不同而导致的无法融合?又或是机型不是问题,而是方法的问题?谢谢!!

请教关于多重比较校正的问题~

 请问一下,当三组间进行完ANOVA的分析后,发现有差异,再进行三组间的两两间的比较。在这个过程中怎么进行多重比较校正呢?应该是先针对ANOVA的结果校正一次,然后在两两比较时再次进行?用REST软件里面的Alphasim可以完成吗?谢谢~!

MY confusion

一直不明白MICA跑出来结果的含义,应该包含两种结果,时间信息和空间信息,不同成分是怎么提取出来的呢?比如说一共提取了27各成分,第1个成分代表了什么呢,是不是在同一时间,在大脑中共有27个信号源?如果是在静息态下的结果,那么时间信息是不是就没用了,只需要分析不同被试静息态下激活网络的不同???并且MICA的manual实在是太简略了,只是告诉操作步骤,并没有将具体是为什么?说有比较清晰的书推荐下,最好是中文的,英文的也可以,只要讲的清楚