August 2015

求助!DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based statistic connectome进行分析?

 各位老师好!
请教一个问题,DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based statistic connectome进行分析?具体问题如下:我用DPARSFA预处理31病人和31对照的rest state fMRI 数据,采用ROI-wise的方法对13个种子点进行FC分析,得到了FC文件夹下的每个subject的TXT文件,然后将这些TXT文件作为每个subject的matrix放入“network based statistic connectome (1.2 version)”软件进行分析,但是一直报错如下:

Error in ==> NBSrun>read_matrices at 369

求助!DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based statistic connectome进行分析?

 各位老师好!
请教一个问题,DPARSFA 预处理后用于得到的FC matrix是否可以直接导入network based statistic connectome进行分析?具体问题如下:我用DPARSFA预处理rest state fMRI 数据,采用ROI-wise的方法对13个种子点进行FC分析,得到了FC文件夹下的每个subject的TXT文件,然后将这些TXT文件作为每个subject的matrix放入“network based statistic connectome (1.2 version)”软件进行分析,但是一直报错如下:

Error in ==> NBSrun>read_matrices at 369

静息态功能磁共振影像方法与应用培训班(REST南宁1511)通知

静息态功能磁共振影像无创,并兼有较好的时间分辨率和空间分辨率,既可以检测脑局部活动进行精准定位,也可以揭示复杂的脑网络系统。静息态功能磁共振影像不仅具有很大的潜在临床应用价值,其“state”设计理念和计算方法也受到心理学家的重视。传统的静息态功能磁共振影像通常指BOLD技术,而随着成像技术与分析技术的进步,动脉自旋标记(ASL)除了提供脑血流的定量指标,还可以分析其时间序列的其它特征(如低频振幅、功能连接等等)。ASL与BOLD几乎可以同时获取,可以从不同的角度揭示生理、心理、病理状态的特征。

老师您好!我用dparsfa做预处理时总是报错?

 老师,您好!非常感谢您开发的一系列软件,给我们带来巨大的方便。我使用dparsfa做批预处理时总是出现如下错误,我试着把部分步骤去除,发现在最初的格式转化上也出现这种错误,不知道是怎么回事,希望得到老师解答,我用的是MATLAB R2014a,SPM8,我的具体参数设置如下图:

   谢谢老师!
  祝老师身体健康,工作顺利!
                                 学生:任靖远
Error using DPARSFA_run>(parfor body) (line 239)

question re multiple ROIs in functional connectivity

 Hi,

My name is Kathryn and I am new to REST toolkit but would like to use it for functional connectivity analyses and have encountered three problems.

REST Alphasim估计平滑,没有残差文件SPM.xVol.FWHM

 各位老师好!

 
 

Normallize 问题

给一个图像做Normalize,出错提示如下,图像在附件中,麻烦各位老师指教,多谢!

Running job #1
------------------------------------------------------------------------
Running 'Normalise: Estimate & Write'
Smoothing by 0 & 8mm..
Coarse Affine Registration..

    * - SPM8: spm_affreg  ----------------------------------------------

关于一篇reho文章的来自reviewer疑问

各位老师好,reviewer提了几个问题,但是其中有两个不知道怎么解释,能帮忙解答下吗?万分感谢!!!

DPARSF预处理报错

 老师您好,我再用dparsf做rest数据预处理时,一直提示错误:

Normalize-Write T1 Image:NC_Sub03_GuoYongLiang OK
Error using spm_bsplinc
File too small.
 
Error in y_Reslice (line 52)
C = spm_bsplinc(SourceHead, d);
 
Error in DPARSFA_run (line 2167)

出现了交互效应怎么处理

在做2*2的 ANOVA 分析(析因分析),影响因素为 分组(有病的,没有病的)和 基因型 (基因型 A和 B)

如果某个脑区  分组 或者 基因型的 主效应显著,解释起来很容易

如果某个脑区交互效应显著,该如何解释,在进一步统计分析时如何处理,麻烦各位老师指点

多谢大家!