关于REST中用“SAVE CLUSTERS”功能保存的MASK的问题

严老师:您好
我发现用REST中用“SAVE CLUSTERS”功能保存的MASK,只有一对带灰度的img文件,不像用‘SAVE CLUSTER’功能会产生一对带灰度的MASK img文件,和一对二进制文件。我想问一下,用那个带灰度的img文件作为MASK进行统计合不合适。问这个问题的关键是我对SPM其内部识别MASK的条件标准不清楚,是只要voxel值大于0就认为是MASK,还是只有voxel值等于1才能认为其是MASK。请严老师多指教。

ROI信号的提取

严老师,

你好!

我现在有一个structural MRI template定义了一些ROIs。这个structural MRI是在MNI space的,并且有skull。

我现在有一些fMRI的data,并将fMRI也normalize到了MNI space. 但是你知道,fMRI没有skull。所以处理完的fMRI和structural template的维数不一样,那么对应的voxel的坐标就不一样,我要怎么提取ROI的信号呢?

非常感激!

Technical Note in GCA

Neuroimage. 2011 May 27. [Epub ahead of print]

Granger causality with signal-dependent noise.
Luo Q, Ge T, Feng J.
SourceDepartment of Mathematics and Department of Management, National University of Defense Technology, Hunan 410073, PR China; Centre for Computational Systems Biology, School of Mathematical Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, PR China.

Abstract

关于srestliceviewer的色阶设置

restsliceviewer的色阶可以采用类似Afni的色阶表现,也可以采用spm的色阶表现,但是均是给出一个下限,范围是[-∞,-下限] and [下限,+∞],但是在一些标准化数据后显示,我希望看到小于-6,-5到-4,-4到-3,-3到-2,2到3,3到4,4到5,5等6及大于6这样的色阶表示方法,不知道能不能通过修改程序,增加参数实现?

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