FC的one sample t-test
老师:
您好。
我看了您的教程。用Rest做one sample t-test ,如果是m*-1的文件就和0比,m*就和1比。
那么,对于功能连接的zFCmap,要和0比还是和1比呢?
- Read more about FC的one sample t-test
- 2 comments
- Log in or register to post comments
- 5578 reads
老师:
您好。
我看了您的教程。用Rest做one sample t-test ,如果是m*-1的文件就和0比,m*就和1比。
那么,对于功能连接的zFCmap,要和0比还是和1比呢?
老师:
您好。
我用rest slice view看我的功能连接的结果,用了ch的underlay。但是发现ch的dimension和voxel size和我的功能像不匹配。
然后我就想对ch.nii用rest进新reslice,但是好像rest只能处理img文件,不能出来nii文件。
是不是我需要把我的功能结果reslice到和ch.nii一样?
请教一下,我用sliceviewer的时候,t值color bar的值会随着数据改变上下限,如何设置统一的上下限,可以使多个结果之间的color bar统一?
如图所示。
我试着设置了range of threshold,但是没有作用。求教,谢谢!
老师,您好。
Warning: There are too few time points.(i.e. The number of the time points is less than 10)
我做了某个ROI的voxel-vised的功能连接,得到zFCMAP,我对2组人的zFCMAP进行two-sample test,然后就出现了以上的Warning. zFCMAP好像不存在时间点这个概念吧。在算功能连接时,不是所有的时间序列的值都平均成一个值了么。
--------------
Image Files in Group 1:
zFCMap_lFFA_AD01_detrend_filtered_Covheadremoved.img
zFCMap_lFFA_AD02_detrend_filtered_Covheadremoved.img
老师们好:
我们使用GE的机子扫描患者BOLD相,扫描240个时间点,33层一共应该有7920幅图像,但是有几个病人导出数据后只有7919幅图,这样能不能进行后序静息态数据处理呢,我用DPARSF跑这样的数据一跑一个错,有没有什么办法能够解决这个问题呢?
报错为:Converting 7919/7919 240
1.2.840.113619.2.244.6945.3202482.22429.1278821188.824.dcm->20100711_143045EPILEPSYF5RENQIANGs004a1001.img
Time elapsed 47594ms
Converting Functional Images:Sub_001 OK
??? Index exceeds matrix dimensions.
Error in ==> DPARSF_run at 274
delete(DirImg(j).name);
各位老师好:
我在用DPARSF进行数据处理过程中,在做完Normalize之后报错,报错内容如下:
Running "Normalise: Write"
--------------------------
Running "Normalise: Write"
Moving Normalized Files:Sub_001 OKMoving Normalized Files:Sub_002 OKMoving Normalized Files:Sub_003 OKMoving Normalized Files:Sub_004 OKMoving Normalized Files:Sub_006 OKMoving Normalized Files:Sub_008 OKMoving Normalized Files:Sub_009 OKMoving Normalized Files:Sub_010 OK
Warning: In the directory "F:\Softs\spm5", spm_bsplinc.mexw32 now shadows
spm_bsplinc.dll.
请教一下,我做事件相关fMRI研究,能否在最后结果中使用AlphaSim矫正?
如果用alphasim矫正,如何写引文出处?
谢谢!
王苏弘
各位老师,
我在用REST 的UTILITY的 SLICE VIEWER , 先设好的Cluster Size 的VOXEL为5,rmm为 4, 再点CI report 后 MATLAB 报错 如下
This report is based on CUI Xu's xjview. (http://www.alivelearn.net/xjview/)
Number of clusters found: 38
----------------------
Cluster 1
Number of voxels: 206505
我将用SPM5处理得到的结果在Rest_slice Viewer中用Montage显示和在xjview中用slice view显示,出现了两种显示下左右脑刚好颠倒了,请问各位老师这是什么原因?Rest_slice Viewer不是参考xjview写的么?
另外,在SPM5中在uncorrect情况下设置p<0.05,对应的t阈值为1.8125,而在Rest_slice View中设置p<0.05,对应的threshold为2.2281。这又是为什么?
老师,您好。
在听您录得教程时,提到过要修改bounding box,说是spm默认的bounding box太小,并提供了一个常用的bounding box的值。
如果我们要处理的数据不是成人,而是小孩,猴子,大鼠等等,我们的bounding box又应该设设多大呢?
我们如何评判bounding box设的合不合适?
bounding box的大小是否要根据voxel size的不同而改变?
麻烦老师了.