Resting-state fMRI topics

dpabi运行时报错

警告: 文件:DPARSFA_run.m 行:760 列:66
临时变量 SliceOrder 将在 parfor 循环的每个迭代开始时被清除。
循环开始前赋给它的任何值都将丢失。如果在 parfor 循环中为它赋值之前使用 SliceOrder,将发生运行时错误。
请参阅 MATLAB 中的并行循环,“临时变量”。
> In DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 1845
In gui_mainfcn at 95
In DPARSFA at 30
警告: 文件:DPARSFA_run.m 行:1128 列:83
临时变量 RefFile 将在 parfor 循环的每个迭代开始时被清除。
循环开始前赋给它的任何值都将丢失。如果在 parfor 循环中为它赋值之前使用 RefFile,将发生运行时错误。
请参阅 MATLAB 中的并行循环,“临时变量”。
> In DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 1845
In gui_mainfcn at 95
In DPARSFA at 30

REST GCA multivariate coefficient results

Dear experts,

I would like to know how to understand and use the results of multivariate coefficient of GCA. I choose the ROI mode.

There are two kinds of .txt in the result folder

1) GCA_sub_*_order1. txt, what is the means of matrix in the text?what is the mean of every columns and rows?

2) ROI_GCA_sub_*.txt, what is the means of matrix in the text?wha is the mean of every columns and rows?

3) How to do statistic analysis with these .txts?

Thanks a lot!

Best wishes,

Lotus

restplus +FC

*.txt文件是什么来,我选择的是voxel wise ROI为aal 37区 海马。FC.nii图像文件在海马的区域应该是为1吧,为什么不是,我认为这是相关系数的矩阵之类,但是在指定ROI里不是1?
还有个问题如果extract roi的话是选zFC?

加入灰质协变量之后就出错

在用dpabi进行TFCE3组之间统计分析的时候,只要加入灰质协变量就显示内存不足,如图片所示,如果不用TFCE就显示矩阵接近奇异值,结果可能不准确。但如果不加入灰质协变量,就能正常跑。这是为什么呢?如果我不加入灰质协变量,这对结果有影响吗,会不会审稿人觉得结果不可靠

杭州师范大学静息态功能磁共振及相关技术网络免费培训(第十六期)

主办单位:
杭州师范大学心理科学研究院
杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
浙江省认知障碍评估技术研究重点实验室

为了加强社会服务,杭州师范大学拟针对静息态功能磁共振影像研究者开展免费培训服务,暂定每月一次。第16期讲座的时间2020年5月30日13:00-17:00。讲座通过网络在线的方式进行。
讲者及简介:
1.题目:任务态fMRI实验设计与数据分析简介
时间:2020年5月30日 13:00-15:00

内容介绍:本次报告摘要分为三个部分:任务态实验设计;任务态用于激活检测(传统GLM分析);任务态用于检测脑区间动态变化(PPI和DCM等)。

REST GUI not loading in Matlab

Hi everyone,

I've been encountering a problem with the REST GUI and I don't understand what the issue is.

After loading REST from Matlab, if I try to load the GUI for any of the functions (ReHo, ALFF, Functional Connectivity...) the GUI won't load.

The toolbox worked just fine until today. I also tried downloading the latest version and I have the same problem.

Any ideas how to fix this?

Thank you,
Robin

Nuisance covariates regression的内部过程

尊敬的老师和同学们好!
在DPABI里有一项“Nuisance Covariates Regression”,默认的regressor有WM,CSF,Global。我想知道回归掉这些regressor的具体过程。
拿WM来说,我的理解是回归的目的就是消除WM对GM产生的影响。
比如:我的fMRI数据有950个时间点,我计算每一个volume的WM和GM的平均值,那么一共能得到950个volume的白质和灰质的数值,通过matlab的regress函数求出了一个线性回归模型:y = 133 + 0.78x(y代表灰质,x代表白质)。
我的问题是:现在怎么通过这个回归模型去除白质对灰质产生的影响呢?还是我的思路根本就不对呢?因为我看nuisance covariates regression处理后的图像像是每个voxel回归后的残差值图像。如果是这样,那么每个voxel的残差值是如何得到的呢?
希望能得到老师或同学们指导,非常感谢!

杭州师范大学静息态功能磁共振及相关技术网络免费培训 (第十四期)

主办单位:
杭州师范大学心理科学研究院
杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
浙江省认知障碍评估技术研究重点实验室

为了加强社会服务,杭州师范大学拟针对静息态功能磁共振影像研究者开展免费培训服务,暂定每月一次。第14期讲座的时间2020年3月21日9:00-12:00。讲座通过网络在线的方式进行。
讲者及简介:
1.题目:fMRI实验设计与数据分析基础
时间:2020年3月21日9:00-11:00

简单介绍任务态核磁共振实验设计的类型和注意事项;同时,简单介绍任务态核磁数据的分析流程及原理。适合fMRI初学者作为入门材料学习。

讲者简介:董光恒,杭州师范大学心理科学研究院教授,主要应用任务磁共振研究网游成瘾的认知神经机制,具有丰富的fMRI实验设计和数据处理经验。目前已经以第一作者或通讯作者发表相关研究的SCI/SSCI论文70余篇,是Addictive behaviors, behavioral and brain functions等期刊编委。

2. 题目:静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景
时间:2020年3月21日11:00-11:40

DPARSF Time Points Error

Hello everyone!

I’m trying to run an analysis of functional data in DPARSF (basic edition, V2.1_120101) and I run into the following error: the program won’t run because the " Time Points " parameter is not correctly set.

I have 370 nifti files per subject, and this also checks out with the scanning parameters – in the file it clearly says “measurements: 370” and if I divide the scanning time by the TR, I get the same result, which is 370.

Error | Forum of resting-state fMRI

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