Resting-state fMRI topics

questions about VBM and reorientation

各位老师好,有几个问题想请教:

1.使用dpabi做VBM,是否就按照dpabi里的VBM模块来处理就可以了呢?
2. 产生的smwc1*.nii是对GM images 进行modulated生成灰质的绝对体积吗?那如何才能得到用个体的体积校正后的值呢?
3. 关于reorient,它是一个optional的选项,所以是不是有可能只有某个被试的图像需要reorient,而不是整个群体一起做?那有没有什么具体的指标和方法来确定需不需要做reorient呢?

谢谢老师,
Icey

gretna求助

老师您好,对于gretna这个工具箱,学生想请教您几个问题:
1. gretna 是否只能去除头动过大的体积,而不去除被试;
2. 对于网络分析部分的输入矩阵是得到的功能连接矩阵吗,还是Fisher‘z变化后的相关矩阵;
3.对于Modular Interaction这一网络属性中Community Index选项的输入是nodal index这个1-90的一列数吗?
望老师能不吝赐教!

将时间序列曲线转换为功率谱密度曲线

老师好,我得到了被试的时间序列,想转换为功率谱密度曲线,请问具体怎么操作?谢谢!
我通过matlab这样做不知道对不对:
x=dlmread('*timecourse.txt');%一个被试的时间序列
y=fft(x); %进行傅里叶转换
N=1060; %数据共有1060 timepoints
fs=1./0.392; %采样频率计算为:1./TR,我数据的TR为0.392s
f=(0:N-1)*fs/N; %计算数据的频域区间f
mag=abs(y); %计算数据的频谱幅值mag
%%%因为从f 向量内发现[ 3:333 ]这个范围频率为0.01-0.08Hz(我只分析这个频率范围),因此取此区间的数值%%%
f1=f (3:333);
mag1=mag(3:333);
power_mag1=mag1.^2; %求数据的功率值
plot (f1,power_mag1) %展示功率谱曲线

此外,我做出来的这张图,横坐标是Hz,纵坐标是什么啊?

老师好,用RESTplus的 extract ROI signals 从ALFF_map*.nii 图像上提取了223个ROI的 signal,请问这个signal是ALFF值吗?如果不是,那我要是想提取每个ROI的ALFF值,应该如何操作?

老师好,用RESTplus的 extract ROI signals 从ALFF_map*.nii 图像上提取了223个ROI的 signal,请问这个signal是ALFF值吗?如果不是,那我要是想提取每个ROI的ALFF值,应该如何操作? 非常感谢!

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