怎样用REST进行左右大脑配准?
老师们好,最近我想对被试的功能像大脑数据做左右配准,之前请教臧老师和严老师后说是将一侧翻转后与另一侧求平均,但是复杂的图像处理我也不会,听老师说REST也可以处理,希望老师能再具体指点下,REST怎样做到左右大脑配准呢?
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老师们好,最近我想对被试的功能像大脑数据做左右配准,之前请教臧老师和严老师后说是将一侧翻转后与另一侧求平均,但是复杂的图像处理我也不会,听老师说REST也可以处理,希望老师能再具体指点下,REST怎样做到左右大脑配准呢?
各位老师好:
我最近开始在用DPARSF进行数据的预处理,折腾了一个多礼拜了,找人看过,自己的数据在别人机子上也跑过,都没问题,但就是在我自己笔记本上跑的时候一直报同一个错误,我把错误信息粘贴过来了,请各位老师、前辈帮我指正指正啊,非常感谢!
我的软件版本:matlab_2012a,rest_1.7,spm_8,DPARSF_2.1
报错信息如下:
尊敬的藏老师及严老师:
你们好。我想请教一个纠结了很久的问题。我现在已经跑完ICA,得到了默认网络和任务相关网络(即执行控制网络)。如果下一步根据下面的文章的做法的话,是不是应该是:用ICA提取这两个网络成分。→SPM对两个网络进行单样本T检验,P设为0.05,FWE校正。→Xjview,将两个网络成分分别保存为Mask。→Dparsf,进行两个Mask之间的功能连接,同时去除协变量,得到这两个网络之间的相关系数。不知道这样做可不可以,期待早日回复。
严老师:
您好!我利用了DPARSF中的DARTEL配准方法实现了功能像的空间标准话,结构像的配准信息只包含了灰质白质脑脊液各自配准后的文件,也有分割文件,我想请教你,怎么利用这些文件实现不分割结构像的配准。因为我想做一个组上的标准化后的平均结构像作为我数据分析的模版。
谢谢!
祝好!
严老师您好,我有几个问题想请教一下,1.如何用灰质做MASK;2.您在《Spatial patterns of intrinsic brain activity in mild cognitive impairment and
alzheimer's disease: A resting-state functional MRI study》这篇文章中是如何做出MMSE与PCC的alff值的相关图;3.下面那副激活图侧脑室旁的激活区域是不是脑脊液的噪声,如果是该如何去掉;如果不是,该如何描述位置
我也要请教严老师一个问题:我已经用它得到了所有的clusters及其相应的参数,但是发现有一些cluster很大,并且列出了很多个脑区,我该从这些脑区中怎么做选择?下面附上一个cluster的参数:
Cluster 1
Number of voxels: 4982
Peak MNI coordinate: 3 -78 6
Peak MNI coordinate region: // Right Cerebrum // Occipital Lobe // Cuneus // Gray Matter // brodmann area 18 // Calcarine_R (aal)
我还有一个问题:我已经用它得到了所有的clusters及其相应的参数,并且列出了很多个脑区,我该从这些脑区中怎么做选择?望各位老师指点,谢谢!
Cluster 1
Number of voxels: 4982
Peak MNI coordinate: 3 -78 6
Peak MNI coordinate region: // Right Cerebrum // Occipital Lobe // Cuneus // Gray Matter // brodmann area 18 // Calcarine_R (aal)
Peak intensity: 15.2169
# voxels structure
Hi Guys,
严老师您好,我这个是双样本得出的多个Cluster ,我想列出一个差异表(最下面)
Cluster 1
Number of voxels: 25
Peak MNI coordinate: 15 -72 3
Peak MNI coordinate region: // Right Cerebrum // Occipital Lobe // Cuneus // White Matter // undefined //
我用的是windows 2003 server, 4G内存
在Detrend 出错,出错时任务管理器显示内存只使用了650M
DPARSF Release=V2.1_120101
rest 1.8 PRE
出错信息如下,多谢指教!
Removing the linear trend: D:
Read 3D EPI functional images: "D:\Pain\Process\FunImgNormalized\20121121002".Out of memory. Type HELP MEMORY for your options.