ZangYF Group's CVs

关于在rest slice viewer中坐标转化的问题；

Submitted by Wei JM on Sat, 10/29/2016 - 16:32

各位老师好，最近在使用rest1.8的过程中遇到了几个问题，特来请教。

我在使用rest viewer的时候发现，用talairach坐标表示的种子点，被转化为mni坐标表示的种子点后其所在脑区发生了变化。例如我想利用谋篇文献中的位于amygdala的一个种子点制作球形ROI，将其talairach坐标转换为mni坐标之后发现该种子点位于HC（原文中的t坐标为29 -2 -15，转换后的mni坐标为30 -2 -21）。

另外，在rest1.8中也可以不用rest viewer进行坐标转换，但是在FC（Fun.Connectivity）中我发现坐标转化的结果和rest viewer是不同的。还是以这个位于amygdala的种子点为例，原文中t坐标为29 -2 -15，利用FC转换之后其min坐标为32 -2 -22。

这两种转化结果应该以哪个为准？

还有，经过坐标转换之后的种子点其所在脑区发生了变化，是不是意味着得出的结果不可用？例如，假设我利用静息态数据发现该种子点的球形ROI与insul之间的功能连接与抑郁得分相关显著，那我的结论是“amygdala与insula之间的功能连接与抑郁得分相关显著”还是“HC与insula之间的功能连接与抑郁得分相关显著”？

还请各位老师不吝赐教，谢谢！

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关于DPARSF数据转移报错的问题

Submitted by Wei JM on Sun, 10/30/2016 - 15:50

各位老师好，有个问题想请教一下。

在使用dparsf（Basic；matlab2014a）处理数据的时候，经常会发现上一步生成的数据没有转移到相应文件夹的错误。比如某些被试第一步数据格式转换的结果，还保留在T1Raw文件夹中，没有转移到相应的T1Img文件夹中，导致在去除前10个时间点的时候报错。检查了很多遍，文件命名没有问题。想知道为何出现这样的错误，该如何解决？

希望各位老师不吝赐教。

 

 

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关于TR时间的疑问

Submitted by shallvin on Sun, 10/30/2016 - 17:51

各位老师：

       我在设置扫描序列时要获得较多的时间点又要满足信噪比，需要TR时间比较长（需要3s），这会对结果有什么影响吗？看严老师的视频只说TR时间较短会受到呼吸和脉搏的信号干扰，但不知道TR时间长除了增加扫描时间对后处理的结果会有什么影响，还请各位老师不吝指教！多谢啦

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关于组间性别比例失调的问题

Submitted by gaolei6096 on Tue, 11/01/2016 - 16:36

臧老师和论坛各位老师，我想请教一个关于组间严重性别比例失调的问题。我们目前采集到一批100人的MRI数据，分成三组，基本上每组30来个受试者，但是三组之间性别比例严重失调，比如第一组女性29/男性5例，第三组男性3/女性30人，第二组男女基本均衡。像这种情况，我们可以直接使用性别变量回归，来报道组间结果吗？这种极端情况不知道先前有类似的文章报道吗？如果不行就意味着我们必须要继续收集受试者来填平性别组间差异吗？
谢谢臧老师！

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Matlab代码解读

Submitted by hood23 on Wed, 11/09/2016 - 12:27

有一段代码，请论坛内大神解读一下，完全读不懂：

clc;clear;

[data voxel head]=rest_readfile('structure.nii');

[dim1,dim2,dim3]=size(data);
Data=zeros(dim1,dim2,dim3);
for j=1:dim3
    Data(:,:,j)=data(:,:,dim3-j+1);
    
end
x=Data(:,:,100);

rest_WriteNiftiImage(Data,head,'new.nii')

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