April 2017

rest层现结果时voxel不在脑区内

Submitted by zhangzongfeng on Thu, 04/27/2017 - 10:39

各位老师，

  我在用rest看结果的时候会有出现异常增强或减低的voxels不在灰质上，在白质上，预处理的时候也是default mask，应该在哪一步如何做来去除这个因素。或者两样本t检验的时候将白质脑脊液成分做协变量？谢谢！

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heatmap

Submitted by lhldrs on Thu, 04/13/2017 - 23:21

 Can the authors provide representative fMRI raw data for both patient and control? Statistics and quantification are well done in the work, but some heatmap images of individual brain activities can make it more intuitive. 

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双样本T检验的Alphasim校正

Submitted by fruitfly on Mon, 04/10/2017 - 19:57

请教各位老师两个问题：

1.对双样本T检验进行Alphasim校正，是选用T检验的结果做为mask？还是选用什么文件作为mask？

2.在确定了cluster之后，在rest的Slice viewer中，输入的P值是输0.01还是输0.05?

谢谢各位老师赐教。

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预处理的疑问以及功能连接校正方法

Submitted by psyzhang on Sun, 04/09/2017 - 21:36
1，在1，在视频中，有关于去除头动较大的数据的问题，里面说的现在很多不在依据A标准（平动和转动大于多少mm）来作为排除标准，而是应用B标准（meanFD>0.2(Jenkinson)）来作为排除标准，而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多，而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了，我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试？因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD（Jenkinson）这个参数，那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了？
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关于fALFF的计算分析

Submitted by YYNL on Thu, 04/06/2017 - 15:02

老师，您好！我最近在做分频段的ALFF和fALFF分析，在计算fALFF时，我对一些参数的设置不确定。

比如我想做0.01-0.027频段的fALFF分析，我在Input Parameters里输入的是不是经过0.01-0.027Hz滤波后的文件（像做ALFF一样）？还是做完去线性漂移（detrend）后的文件？

注：Option:Ideal Band Pass Filter 这一栏之所以没设，是因为我已经做完了0.01—0.027 Hz的滤波。

还有Band Hint 这一栏是不是也要设置为0.01—0.027（如下图）？其他参数设置有什么要注意的吗？

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