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Tue, 08/09/2016 - 21:21lionkiss老师好,我投出去的ALFF的文章被拒了,一个reviewer说不太愿意接受alphasim的校正,如果要有,至少要clusters在100-200才可以接受。 我用FDR做了,没有结果。 但是用rest推荐的GRF的结果做出来的却非常不错,比alphasim的cluster大好多,每个cluster都在100以上了。 但是我有点疑问,是不是GRF的校正使用不太普遍? 我看到网上的文章大多使用alphasim或者FDR和FWE,GRF似乎只有不多的几篇。 GRF是可以被普遍接受的校正方法么?15875 reads
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Tue, 08/09/2016 - 11:20ClassicBear① REST image calculator可以计算一组图像的平均图像(mean(g1)),请问怎么计算一张图像的平均值吗? ② REST可以将一张T图转换成Z-score图吗?( i-mean(g1))/std(g1)这个计算的是i1相对于一组图的z-score图?如果我想把一个双样本t检验的T图转成Z图,请问怎么转? 谢谢老师!5196 reads
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Mon, 08/01/2016 - 20:40likening刚刚开始接触fmri数据的预处理,之前做field map矫正一直用的是SPM,现在想用FSL完成field map,看看两个软件处理的结果有什么不同。所以想向各位老师请教一下:1. FSL实现field map时需要fieldmap image和brain-extracted fieldmap magnitude image(如下图),这和SPM里面的phrase image和magnitude image一样吗?FSL官网上哪里可以找到样本数据? 2. 不知道有没有老师分别用两个软件实验过,...5251 reads
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Mon, 08/01/2016 - 19:38jiaxize主办单位: 广西南宁灵康赛诺科生物科技有限公司 讲师单位: 杭州师范大学认知与脑疾病研究中心 中国科学院心理研究所 北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室 首都医科大学宣武医院 静息态功能磁共振影像无创,并兼有较好的时间分辨率和空间分辨率,既可以检测脑局部活动进行精准定位,也可以揭示复杂的脑网络系统。静息态功能磁共振影像不仅具有很大的潜在临床应用价值,其“state”...3508 reads
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Mon, 08/01/2016 - 17:18Yong sengHi I am hoping to get help with a difficulty that I'm having whilst running restplus. It was at the following step that the run terminated. I had uploaded a nii.gz file as ROI demarcating a region of the ventral default mode network sourced from the...5478 reads
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Sat, 07/23/2016 - 22:10qizhi老师,您好! 我目前正在使用dparsf 4.0 for monkey data 版本处理静息态猴子脑数据,采用的参数设置如下(事先已经去除了前6个时间点): 图1 参数设置 已经顺利完成了slice timing和realignment,到了reorient 那一步就不太清楚如何设置参数进行,用spm8里面的display显示了一下功能像如下,正确的应该是左上图是冠状位(coronal),左下是轴状位(axial),右上是矢状位(sagittal),可是我的功能像却是左上是轴状位,左下是冠状,...9427 reads
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Fri, 07/22/2016 - 11:42yanyisecret各位老师,大家好,我现在在使用dpabi进行alphasim校正的时候遇到一个问题,希望老师能予以解答。 基本信息如下:我将VBM处理之后的SPMT图导入之后,选择重采样之后的mask文件,估计了平滑核等参数,然后iteration选择默认的1000,p选择了0.05,出现如下报错信息,如果p为0.01的话则可以顺利进行。 还有一个问题就是,在这种情况下,可以不可以使用p为0.01的这个文件看p为0.05的时候的voxels填入xjview等软件进行结果的查看?8203 reads
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Fri, 07/22/2016 - 11:33小皮蛋你好!看到有人用rest做统计分析时,先做两组被试的单样本T检验,得到的显著区域做并集mask,在这个mask下进行双样本T检验。如果是在全脑做的双样本T检验,rest只产生一个T图,那么在做alphasim较正的时候,估计平滑核用什么mask呢,下面的mask要用AAL模板吗?可是有人说估计平滑核的mask和下面的mask要用相同的,用spm可以产生mask,但是rest没有生成相关文件该怎么办呢?谢谢!11100 reads
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Thu, 07/21/2016 - 06:11allanwHi all, I have a quick question and I was hoping somebody might be able to help me. I have an a priori hypothesis about the involvement of Wernicke's area in a group of patients, and would like to use the AAL template regions to create an ROI. The AAL regions...2842 reads
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Wed, 07/20/2016 - 20:58luohaha老师: 您好。我想请教一下您关于SPM8做双因素析因设计方差分析,希望您能在百忙中抽空回复。我想分析一下疾病诊断ZD(正常人,焦虑患者)的脑皮层灰质密度与基因型JY(危险基因位点,正常基因位点)的关系。我之前在网上找了很多资料,都没有办法解决疑问。 我分析的过程是:首先要分析的图像是经分割并平滑后图像,SPM8中选specify 2nd-level,参数如下: 分析完后得到SPM.mat,选择SPM....11404 reads