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Thu, 10/14/2010 - 15:22nutrition-li有个小问题,我一直想不明白,请大家帮忙。 在一幅fMRI图像中,BOLD信号具体数值是多少?怎么样才能看到这个数据? 举个例子,有篇文章得到了下面的统计图,我想知道BOLD信号的数值是怎么得到的,用SPM能实现吗?13518 reads
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Thu, 10/14/2010 - 15:22nutrition-li有个小问题,我一直想不明白,请大家帮忙。 在一幅fMRI图像中,BOLD信号具体数值是多少?怎么样才能看到这个数据? 举个例子,有篇文章得到了下面的统计图,我想知道BOLD信号的数值是怎么得到的,用SPM能实现吗?5296 reads
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Wed, 10/06/2010 - 00:12marvelancetHi everybody, I'm currently processing a series of rest fmri data which need to be manually normalized. The procedure briefly goes like this: -- dparsf completed the pre-normalization steps from 'dicom->nifti' to 'realign' -- toggle...7405 reads
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Tue, 10/05/2010 - 16:46nutrition-li请问谁用时间簇分析法(TCA)处理过fMRI数据啊? 想知道这种方法需要使用什么样的软件,是怎样实现的。 谢谢大家!9819 reads
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Mon, 10/04/2010 - 17:02nutrition-li最近在看一篇文章,有些数据分析方面的问题搞不清楚,如果有人处理过类似的数据,请不吝赐教。谢谢! MR Image Acquisition Images were acquired with a multislice, singleshot EPI sequence to achieve whole brain coverage: 40 axial slices, TR=5 seconds, TE =35 illiseconds, 3.5-mm slice thickness, in-plane...14124 reads
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Mon, 10/04/2010 - 13:52Dinos2010Hi all, In the article "Detection of functional networks in the resting brain" there was a step before group analysis involving transforming the individual Reho data to normal distribution. Has this function been implemented in REST ? If yes, what...7825 reads
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Sun, 10/03/2010 - 22:16marvelancet近期碰到几个问题 拿出来大家看看: 做统计分析结果呈现的时候,因为是手动配准,用的AFNI tlrc坐标,最终结果在各种工具中呈现结果不同: rest slice viewer效果最好,与模板匹配 同样的结果放到MRIcroN就不匹配(我用的模板和mask是同源的) 可能是MNI坐标与tlrc坐标不同的关系 在spm里面也一样 不匹配: 另外,结果呈现的时候,如果安装的是matlab2010a版,图形匹配没问题,但是效果不好,会有异常的黑圈包绕,换一个较低版本的就没问题(2008b,...6389 reads
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Sat, 10/02/2010 - 23:17marvelancet亲爱滴们: 今天碰到这样一个问题,焦头烂额: 由于这批数据需要手动配准,所以我的处理流程如下: 1. 用dparsf批处理至realign。 2.用spm做coregister. 3.用AFNI转换格式后做Normalize 4.转换个格式后,将得到的EPI相文件放入FunImgNormalized文件夹。 然后启动dparsf, 先跳过Smooth做的ReHo,很顺利,detrend, filter, reho...没有任何问题。 然后继续用dparsf做alff以及falff,操作过程如下: ...39958 reads
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Fri, 10/01/2010 - 12:08marvelancet坛主, 这批数据比较早,2005年GE机器,TR 1s, 16sl, 200TR. 使用Sorter时候报错: ??? Error using ==> mkdir 系统找不到指定的文件。 Error in ==> rest_DicomSorter at 38 mkdir(dirname); Error in ==> rest_DicomSorter_gui>...5149 reads
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Fri, 10/01/2010 - 07:36marvelancethi, the previous error i brought up was fixed by adding the line "rest_Fix_Read_Write_Error" before initializing dparsf. however, the time between pressing the bottom "run" and actual data precessing is much longer...40839 reads