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Thu, 04/07/2016 - 21:08jiaxize在fMRI中,MASK也是一副脑图,如果用看图软件(如MRIcron,REST Viewer等)打开一副MASK,就会发现,这幅图上面的数值,只有0或者1。MASK脑图通常的作用是去掉我们不感兴趣的区域。我分一下几个步骤介绍。 (1)如何做MASK 得到MASK的方式有很多,比如我们做完统计检验,可以得到一张T图,卡完阈值后,我们可能只对某一个特定的cluster感兴趣,这样我们就可以做一个mask,这个mask只包括我们特定感兴趣的cluster。或者是,我们对某一个AAL脑区感兴趣,想把这个脑区做成MASK...5168 reads
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Thu, 04/07/2016 - 20:33jiaxizeRESTplus软件中的功能连接模块有两个选项:ROI wise和voxel wise。 voxel wise的功能连接(文章中有时也叫seed based),是指,我们指定一个ROI,将这个ROI内的信号做平均后得到一条平均时间序列。然后用这条时间序列,与全脑其他体素逐个做相关,这样就会得到一副脑图,脑图的每个voxel位置都有一个r值,意思是该voxel的时间序列,与种子点时间序列的相关大小(功能连接强度)。所以,voxel wise的功能连接选择后,得到的结果会有一张脑图,还会有一个txt文本文档,...10398 reads
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Tue, 04/05/2016 - 22:55echoqiu77各位大牛请教一下, 我用rest做的ANOVA,做完以后想做一下事后检验,看看到底是哪些组间出现的变化,应该怎么做呢? 跪谢!17856 reads
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Mon, 04/04/2016 - 16:57lionkissIn an assignment A(I) = B, the number of elements in B and I must be the same. 各位老师,真奇怪,以前的做slicetiming的时候没有遇到这个问题,这是matlab出错,还是spm的出错,还是我的数据有问题呀?6054 reads
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Sat, 04/02/2016 - 02:20echoqiu77老师: 您好! 我之前的rest都用得挺好,最近不知为何rest的viewer 打不开了,出现如下报错,请教一下这是什么原因引起的呢? Error using sprintf Function is not defined for 'matlab.ui.Figure' inputs. Error in rest_sliceviewer>InitControls (line 940) ...5094 reads
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Tue, 03/29/2016 - 17:59yubingREST工具包里面提供了非常好的 Regress out variable功能,可以在进一步处理前消除很多干扰因素 请教各位老师:这个工具包进行的是参数回归吧?可以直接用这个插件进行非参数回归吗? 如果需要用非参数回归的方式消除干扰变量,参考或者使用哪个软件为好?多谢!5750 reads
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Sun, 03/27/2016 - 23:14sufan尊敬的老师您好: 我论坛上看到有同学请教关于杏仁核体积计算的问题,看了您的解答有些细节的问题我还不是很清楚,在此向您进一步请教。 我目前的情况是要分析一批受试者海马的volume,我是用VBM8做的结构像分析,想用ALL模板中的海马做MASK提取结构像的ROI信号作为海马体积,不知道这样的思路是否正确。 其次,...12587 reads
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Sun, 03/20/2016 - 17:48wujingxiREST1.8界面上有个输入p值的地方,在这之前,我做了AlphaSim校正, 这个p是做alphasim校正时候填写的individual p value(比如p=0.01或者0.005) ?还是最后看组分析结果时候的p value (比如p<0.05)?13606 reads
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Sun, 03/20/2016 - 17:44jiaxize第二期 ASL Perfusion MRI培训班 主办单位: 杭州智脑科技有限公司 培训时间:2016年6月3日-6日 培训地点: 浙江省委党校文欣校区 1. 培训简介 动脉血标记灌注成像是不需要外源性造影剂的无创测量脑血流的磁共振成像技术。相比其它测量脑血流的技术而言,ASL有着非常显著的优势。第一是无创和没有任何放射性,不需要注射任何造影剂;第二是可多次重复测量。是临床横向和纵向比较包括随访研究不可多得的工具。在认知科学研究方面,ASL...5821 reads
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Sun, 03/20/2016 - 09:39jiaxize我们在MRI中拿到的原始数据是DICOM格式的,扫描机器品牌不同,扩展名可能不一样(如扩展名为IMA、DCM或没有扩展名),这些都属于DICOM格式。我们在使用相应的fMRI处理软件进行数据分析前,都会使用对应的工具首先进行格式转换,比如RESTplus默认会将数据转换为NIFTI格式(.nii扩展名)。不同软件的默认文件格式是不一样的,比如AFNI的默认格式有两个文件HEAD文件和BRIK文件。也就是说,假如你使用AFNI的命令来做数据处理,如果没有特殊设置,通常来讲得到的文件会是一对文件:HEAD和BRIK。...6560 reads