欢迎到静息态功能磁共振成像论坛
Welcome to the forum of resting-state fMRI

bug in AlphaSim?

Dear REST experts,

Recently a shocking paper has been published which criticize the use of cluster-based parametric correction:

http://www.pnas.org/content/early/2016/06/27/1602413113

tomowillco注册邮件错误

tomowillco用户你好:
你留的邮箱退信,显示邮件错误,请重新注册或者与我联系zangyf@gmailc.om

“eddy- current” toolbox in FSL.

Firstly, all the images  should be corrected with the “eddy- current” toolbox in FSL.

臧老师好,reviewer提出使用T1图像做协变量前,需要用FSL做这个步骤?呃,我手头没有FSL软件,有啥可以替代的么?

平滑的选择是有要求的么?

reviewer提问,为啥一定是444的平滑?

我查了下,似乎有地方提出,平滑核的选择应该是voxel的1.5倍数,voxel是333,那么应该是4.5?

关于alphasim的使用

各位前辈好!

      我现在做了一个两样本t检验,打算在rest里面使用alphasim来估计cluster size,首先需要估计平滑核,具体界面见附件。里面需要输入三个文件才能估计平滑核,其中中间的mask file是做两样本t检验的mask吗?那其余的input statistical map和 FWHM of statistical map需要输入什么呢?

      谢谢各位!

rest1.8 EXTRACT ROI SIGNAL and FC

    rest 里面的extract ROI Signal功能,我用自己弄的90个脑区作为ROI,最后得到的resultCorr.txt(90*90矩阵),是90个脑区的相关系数,接着去除了这90个脑区的协变量,再做了功能连接之后的ROI-WISE也得到FCMap.txt 或zFCMap.txt(90*90矩阵),这个也是90个脑区相关系数。

臧玉峰文章引用检索报告

编号:2016-NLC-LWCZ-1371
 
 
 
检 索 报 告
 
检索课题:臧玉峰发表的学术论文被SCI和SSCI、ESI数据库收录引用情况
委托单位:杭州师范大学
委 托 人:臧玉峰
检索工具:
 Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) 1900-pre
Social Sciences Citation Index (SSCI)

北师大心理学院的11212015246错误邮箱

北师大心理学院的11212015246新注册用户您好:你留的信箱可能是错误的,无法完成注册。请与我联系。zangyf@gmail.com

Help running the multimedia course part 1

Hi, 

I am new at using dpabi, so I am trying to use the multimedia course module part 1. However when I try to run the sample data after selecting choices as shown on the video, I obtained the following message on MATLAB:

如何分析三组被试ALFF在哪些脑区有差异并与行为学指标进行相关分析

(新手)我有三组数据要进行分析,下面是我尝试的分析处理过程,但是不知道对不对,求老师指导一下,谢谢!

利用rest首先进行的ANOVA,找到差异性显著的clusters,(不知如何选择ROI做mask,所以只是单纯的存为clusterA.txt)。然后进行two sample t-test,又出来一些差异性显著的clusters,3组每进行两两比较就得到3个这样的clusters,分别记为cluster1,2,3。然后我将clusterA中具体的cluster与cluster1,2,3中的进行比对,将能对应起来的看作是两两比较时有差异性的脑区。这样做对吗?如果不对的话,麻烦教一下正确的方法。

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