heatmap

 Can the authors provide representative fMRI raw data for both patient and control? Statistics and quantification are well done in the work, but some heatmap images of individual brain activities can make it more intuitive. 

双样本T检验的Alphasim校正

请教各位老师两个问题:

1.对双样本T检验进行Alphasim校正,是选用T检验的结果做为mask?还是选用什么文件作为mask?

2.在确定了cluster之后,在rest的Slice viewer中,输入的P值是输0.01还是输0.05?

谢谢各位老师赐教。

预处理的疑问以及功能连接校正方法

1,在1,在视频中,有关于去除头动较大的数据的问题,里面说的现在很多不在依据A标准(平动和转动大于多少mm)来作为排除标准,而是应用B标准(meanFD>0.2(Jenkinson))来作为排除标准,而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多,而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了,我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试?因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD(Jenkinson)这个参数,那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了?

关于fALFF的计算分析

老师,您好!我最近在做分频段的ALFF和fALFF分析,在计算fALFF时,我对一些参数的设置不确定。

比如我想做0.01-0.027频段的fALFF分析,我在Input Parameters里输入的是不是经过0.01-0.027Hz滤波后的文件(像做ALFF一样)?还是做完去线性漂移(detrend)后的文件?

注:Option:Ideal Band Pass Filter 这一栏之所以没设,是因为我已经做完了0.01—0.027 Hz的滤波。

还有Band Hint 这一栏是不是也要设置为0.01—0.027(如下图)?其他参数设置有什么要注意的吗?

关于ReHo值的两样本T检验结果请求答疑

各位老师好:

      我在用DPARSF软件进行静息态的fMRI数据处理,在按照严超赣老师的教程处理后,进行两样本T检验计算ReHo值的差异,用Viewer观察结果图发现: AlphaSim校正后,在非脑组织区域也存在着显著差异结果,比如蔓延到脑壳或者脑膜上,可以在我的附加图中看到,我同时也附加了HC组ReHo单样本T检验的图。

      我不明白出现这种情形的原因是什么? 因为我观察在文献中都没有出现过这非脑组织表现出显著差异的情形,请问这样是正常的吗? 还是我的配准过程出现问题?  我在PicturesForChkNormalization文件夹中检查的结果有几个配的不太好的我都已经删除了被试。附件Sub_001的结果是属于绝大部分被试的配准效果,Sub_005这种配准不好的我都删除了。

     所以我的疑问就是在非脑组织中出现显著差异的结果是正常的吗? 如果不正确我应该如何检查并解决问题呢?

     学生刚刚接触静息态数据分析,还望各位老师能够帮助解答疑惑~

     非常感谢!