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关于用Rest做相关

各位大侠, 请教一下,在用REST做相关分析时遇到的问题:

我首先计算了ROI在治疗前后分别和全脑的相关,然后我想用治疗前后做Paired—t test的结果的差值来和临床做相关,我本来打算把这个差值的脑区作成一个mask,用Rest算这个功能连接的变化和临床变化的相关,不知道这种方法对不对?如果用这个方法的话,Rest功能连接这个Add Group Images 的地方应该加入那组数据呢?

非常感谢!

Re: Rat brain data

Hi

I downloaded your software and trying to run resting state for my data. Before that I would like to test your data, I was able to watch the video file on the animal data. Is there anyway I can download your sample data, to test it? Please let me know.

Thanks

Ned

GRF校正的疑惑

老师好,我投出去的ALFF的文章被拒了,一个reviewer说不太愿意接受alphasim的校正,如果要有,至少要clusters在100-200才可以接受。
我用FDR做了,没有结果。
但是用rest推荐的GRF的结果做出来的却非常不错,比alphasim的cluster大好多,每个cluster都在100以上了。
但是我有点疑问,是不是GRF的校正使用不太普遍? 我看到网上的文章大多使用alphasim或者FDR和FWE,GRF似乎只有不多的几篇。

GRF是可以被普遍接受的校正方法么?

请问REST里面的Image Calculator可以计算一张图像的平均值吗?

① REST image calculator可以计算一组图像的平均图像(mean(g1)),请问怎么计算一张图像的平均值吗?

② REST可以将一张T图转换成Z-score图吗?( i-mean(g1))/std(g1)这个计算的是i1相对于一组图的z-score图?如果我想把一个双样本t检验的T图转成Z图,请问怎么转?

谢谢老师!

对fmri数据怎么用FSL完成field map矫正?

静息态功能磁共振影像方法与应用培训班(REST南宁1610)

主办单位:
 
广西南宁灵康赛诺科生物科技有限公司
 
 
讲师单位:
 
杭州师范大学认知与脑疾病研究中心
 
中国科学院心理研究所
 
北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室
 
首都医科大学宣武医院
 
 
 
静息态功能磁共振影像无创,并兼有较好的时间分辨率和空间分辨率,既可以检测脑局部活动进行精准定位,也可以揭示复杂的脑网络系统。

使用dparsf for monkey 版本处理猴子的脑数据,如何进行reorient

老师,您好!

我目前正在使用dparsf 4.0 for monkey data 版本处理静息态猴子脑数据,采用的参数设置如下(事先已经去除了前6个时间点):

图1 参数设置

 

关于dpabi进行alphasim报错

各位老师,大家好,我现在在使用dpabi进行alphasim校正的时候遇到一个问题,希望老师能予以解答。

基本信息如下:我将VBM处理之后的SPMT图导入之后,选择重采样之后的mask文件,估计了平滑核等参数,然后iteration选择默认的1000,p选择了0.05,出现如下报错信息,如果p为0.01的话则可以顺利进行。

还有一个问题就是,在这种情况下,可以不可以使用p为0.01的这个文件看p为0.05的时候的voxels填入xjview等软件进行结果的查看?

用rest做统计分析

你好!看到有人用rest做统计分析时,先做两组被试的单样本T检验,得到的显著区域做并集mask,在这个mask下进行双样本T检验。如果是在全脑做的双样本T检验,rest只产生一个T图,那么在做alphasim较正的时候,估计平滑核用什么mask呢,下面的mask要用AAL模板吗?可是有人说估计平滑核的mask和下面的mask要用相同的,用spm可以产生mask,但是rest没有生成相关文件该怎么办呢?谢谢!

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