ICA,One(two) sample t-test
我用GIFT(Group ICA fMRI Toolbox)对fMRI数据做了ICA。
问题:对于GIFT得到的结果,我可以用REST来做统计分析吗(比如t-test,多重比较等等)?
谢谢了!!
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我用GIFT(Group ICA fMRI Toolbox)对fMRI数据做了ICA。
问题:对于GIFT得到的结果,我可以用REST来做统计分析吗(比如t-test,多重比较等等)?
谢谢了!!
现在有一批在GIFT(Group ICA fMRI Toolbox)上做ICA后得到的fmri数据。
问题: REST操作简洁,我可以用REST对这批数据做之后的统计分析吗?比如t-test等等??
谢谢!
我们在MRI中拿到的原始数据是DICOM格式的,扫描机器品牌不同,扩展名可能不一样(如扩展名为IMA、DCM或没有扩展名),这些都属于DICOM格式。我们在使用相应的fMRI处理软件进行数据分析前,都会使用对应的工具首先进行格式转换,比如RESTplus默认会将数据转换为NIFTI格式(.nii扩展名)。不同软件的默认文件格式是不一样的,比如AFNI的默认格式有两个文件HEAD文件和BRIK文件。也就是说,假如你使用AFNI的命令来做数据处理,如果没有特殊设置,通常来讲得到的文件会是一对文件:HEAD和BRIK。做完的这个结果,如果想用RESTplus做进一步分析,先用对应命令(3dAFNItoNIFTI)做一个格式转换就可以了。NIFTI是一种通用格式,大多数软件都支持NIFTI格式。同理,RESTplus处理完的结果,默认都是NIFTI格式的,可以直接拿到支持NIFTI格式的软件中使用。
第二期 ASL Perfusion MRI培训班
主办单位: 杭州智脑科技有限公司
培训时间:2016年6月3日-6日 培训地点: 浙江省委党校文欣校区 |
1. 培训简介 Forums:
REST Alphasim P值
Submitted by wujingxi on Sun, 03/20/2016 - 17:48
REST1.8界面上有个输入p值的地方,在这之前,我做了AlphaSim校正,
这个p是做alphasim校正时候填写的individual p value(比如p=0.01或者0.005) ?还是最后看组分析结果时候的p value (比如p<0.05)?
Forums:
请教关于灰质体积计算的问题
Submitted by sufan on Sun, 03/27/2016 - 23:14
尊敬的老师您好: 我论坛上看到有同学请教关于杏仁核体积计算的问题,看了您的解答有些细节的问题我还不是很清楚,在此向您进一步请教。 我目前的情况是要分析一批受试者海马的volume,我是用VBM8做的结构像分析,想用ALL模板中的海马做MASK提取结构像的ROI信号作为海马体积,不知道这样的思路是否正确。 其次,VBM分析后产生的数据有m0wrp1和m0wrp2,这个我的了解是分别对用的灰质和白质的volume,那我要提取海马的信号,是不是直接用m0wrp1的图像来做呢?还有我看VBM使用手册中提到的结构像的平滑,平滑之后产生的数据是sm0wrp1,那请问我应该使用平滑之前还是之后的数据来提取海马的信号呢? Forums:
Rest 的 Regress out 功能
Submitted by yubing on Tue, 03/29/2016 - 17:59
REST工具包里面提供了非常好的 Regress out variable功能,可以在进一步处理前消除很多干扰因素 请教各位老师:这个工具包进行的是参数回归吧?可以直接用这个插件进行非参数回归吗? 如果需要用非参数回归的方式消除干扰变量,参考或者使用哪个软件为好?多谢! Forums:
rest viewer 无法运行
Submitted by echoqiu77 on Sat, 04/02/2016 - 02:20
老师: 您好! 我之前的rest都用得挺好,最近不知为何rest的viewer 打不开了,出现如下报错,请教一下这是什么原因引起的呢? Error using sprintf Function is not defined for 'matlab.ui.Figure' inputs.
Error in rest_sliceviewer>InitControls (line 940) Forums:
新扫了一组数据,slicetiming 出错了。
Submitted by lionkiss on Mon, 04/04/2016 - 16:57
In an assignment A(I) = B, the number of elements in B and I must be the same. 各位老师,真奇怪,以前的做slicetiming的时候没有遇到这个问题,这是matlab出错,还是spm的出错,还是我的数据有问题呀? Forums:
关于ANOVA处理数据的事后比较
Submitted by echoqiu77 on Tue, 04/05/2016 - 22:55
各位大牛请教一下, 我用rest做的ANOVA,做完以后想做一下事后检验,看看到底是哪些组间出现的变化,应该怎么做呢? 跪谢! Forums:
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