ZangYF Group's CVs

FCS 和 Degree Centrality

各位老师:

     我读到有一篇文献计算了“FCS(functional connectivity strength) : at a given voxel x0 was computed as the average of functional connectivity between x0 and all other voxels in the brain”

    麻烦各位指教, FCS与 REST 软件包计算出来的 “Degree Centrality” 有什么联系和区别?多谢!

常用的可以对ALFF或者ReHo运用的Data reduction strategies 有哪些呀?

There are so many regions and these regions appear to potentially align with networks.  Data reduction strategies may aid in streamlining the many results reported here.
有个reviewer给我这条意见,一头雾水,这该咋整呢?

有关voxel-wise的疑惑

各位老师好:

       我有一个困惑一直没有想明白,希望能得到各位的指点,非常感谢。在做voxel-wise的分析时,我选择了一个种子点,用dparsf先做了预处理,然后用rest做的voxel.结果是每个被试出现1×124 的txt文件。不是应该种子点的平均时间序列与全脑每个体素的时间序列做分析吗,全脑就124个体素吗?(数据的的timepoints是124,处理的结果跟time points 有关系吗 )希望能得到大家的指点。。。

有关voxel-wise的疑惑

各位老师好:

       我有一个困惑一直没有想明白,希望能得到各位的指点,非常感谢。在做voxel-wise的分析时,我选择了一个种子点,用dparsf先做了预处理,然后用rest做的voxel.结果是每个被试出现1×124 的txt文件。不是应该种子点的平均时间序列与全脑每个体素的时间序列做分析吗,全脑就124个体素吗?(数据的的timepoints是124,处理的结果跟time points 有关系吗 )希望能得到大家的指点。。。

rest的ANOVA分析当中似乎没有对于协变量交互作用的测量么?

我有个疑问,rest的ANOVA加入灰质体积等协变量,相当于协方差计算,那么如果协变量如果有交互作用,是不是不能进行协方差的计算?

我用rest做了ANOVA,用了年龄,性别,教育,灰质图像作为协变量,然后我提取数值在SPSS中计算的时候,发现,灰质和我的组有交互作用,结果和我用rest做的完全相反。

Online Video: Resting-State fMRI Free Webinar Course (Jan 25th, 2016)

The Resting-State fMRI Free Webinar Course was held on Jan 25th, 2016. The focus of the course are the principles of R-fMRI and its applications to brain disorders, as well as data analysis with REST plus (Resting-State fMRI Data Analysis Toolkit) and DPARSF (Data Processing Assistant for Resting-State fMRI). 

三个完全不同的被试组进行比较,做了ANOVA之后,是不是不应该做双样本t-test?

三个完全不同的被试组进行比较,做了ANOVA之后,是不是不应该做双样本t-test?

我用rest做了anova和双样本ttest之后,提取anova的不同cluster的三组数值在spss里面做了anova和post-hoc。

似乎spss的结果非常符合我的假设,我的假设是1组>2组>NC组

rest做的图像双样本虽然大方向没啥问题,但是不太精确。

我的理解是rest在三组之间做的双样本ttest增加了第一类统计错误,所以不够准确么?

 

到底是rest给的图像准确,还是spss的准确呢?

FWE、FDR、AlphaSim correction

First, when do two sample t test, I need a mask.

And I want to use one sample t test's results (corrected) of two groups to make a mask.

In REST, I use FWE、FDR、AlphaSim correction respectively for one sample t test's results, and all successful.

But Now, my question is that ...

                                                 which correction method's result should I choose ?

3D ASL数据分析问题

各位好

         我在Upenn神经成像中心的磁共振机器上扫完ASL之后生成的3DASL数据只有两个:一个mean*3D图像文件和一个mean*dat文件,跟restplus中3D ASL normalzie的help里提到的有cbf.nii和pfefmo.nii似乎不同, 在外人的帮助下,我们将这个mean图像转换生成了60个f*.nii文件和另外三个文件(M000.nii, M002.nii, meanperf.nii),似乎跟王泽老师的ASLtbx里差异比较大,如果用restplus分析,接下来该怎么做呢?谢谢!

请问用rest怎样提取纹状体灰质体积,能通过predefine ROI from ALL template by selecting specific area 进行吗?

请问用rest怎样提取纹状体灰质体积,能通过predefine ROI from ALL template by selecting specific area 进行吗?还有用SPM算VBM得出的nii图像怎么用rest打开?总是提示要reslice,但是当用reslice功能时根本无法打开SPM得出的nii图像?请问这该怎么解决呢?

我的目的是把一组被试的纹状体体积提取出来,然后与其某个脑区的ALFF值做相关。谢谢老师!