REST工具包里面提供了非常好的 Regress out variable功能，可以在进一步处理前消除很多干扰因素
请教各位老师：这个工具包进行的是参数回归吧？可以直接用这个插件进行非参数回归吗？
如果需要用非参数回归的方式消除干扰变量，参考或者使用哪个软件为好？多谢！
尊敬的老师您好：
我论坛上看到有同学请教关于杏仁核体积计算的问题，看了您的解答有些细节的问题我还不是很清楚，在此向您进一步请教。
我目前的情况是要分析一批受试者海马的volume，我是用VBM8做的结构像分析，想用ALL模板中的海马做MASK提取结构像的ROI信号作为海马体积，不知道这样的思路是否正确。
其次，VBM分析后产生的数据有m0wrp1和m0wrp2，这个我的了解是分别对用的灰质和白质的volume，那我要提取海马的信号，是不是直接用m0wrp1的图像来做呢？还有我看VBM使用手册中提到的结构像的平滑，平滑之后产生的数据是sm0wrp1，那请问我应该使用平滑之前还是之后的数据来提取海马的信号呢？
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第二期 ASL Perfusion MRI培训班
主办单位： 杭州智脑科技有限公司
培训时间：2016年6月3日-6日 培训地点： 浙江省委党校文欣校区 |
1. 培训简介 Forums:
[FAQ] 其它fMRI数据分析软件（如AFNI、MICA、GIFT）的结果是否可以用RESTplus继续分析
Submitted by jiaxize on Sun, 03/20/2016 - 09:39
我们在MRI中拿到的原始数据是DICOM格式的，扫描机器品牌不同，扩展名可能不一样（如扩展名为IMA、DCM或没有扩展名），这些都属于DICOM格式。我们在使用相应的fMRI处理软件进行数据分析前，都会使用对应的工具首先进行格式转换，比如RESTplus默认会将数据转换为NIFTI格式（.nii扩展名）。不同软件的默认文件格式是不一样的，比如AFNI的默认格式有两个文件HEAD文件和BRIK文件。也就是说，假如你使用AFNI的命令来做数据处理，如果没有特殊设置，通常来讲得到的文件会是一对文件：HEAD和BRIK。做完的这个结果，如果想用RESTplus做进一步分析，先用对应命令（3dAFNItoNIFTI）做一个格式转换就可以了。NIFTI是一种通用格式，大多数软件都支持NIFTI格式。同理，RESTplus处理完的结果，默认都是NIFTI格式的，可以直接拿到支持NIFTI格式的软件中使用。 Forums:
ICA
Submitted by wujingxi on Thu, 03/17/2016 - 14:14
现在有一批在GIFT（Group ICA fMRI Toolbox）上做ICA后得到的fmri数据。 问题： REST操作简洁，我可以用REST对这批数据做之后的统计分析吗？比如t-test等等？？ 谢谢！ Forums:
ICA，One(two) sample t-test
Submitted by wujingxi on Thu, 03/17/2016 - 14:08
我用GIFT(Group ICA fMRI Toolbox)对fMRI数据做了ICA。 问题：对于GIFT得到的结果，我可以用REST来做统计分析吗（比如t-test，多重比较等等）？ 谢谢了！！ Forums:
请问用rest怎样提取纹状体灰质体积，能通过predefine ROI from ALL template by selecting specific area 进行吗？
Submitted by haishijiandanhao on Thu, 03/17/2016 - 01:46
请问用rest怎样提取纹状体灰质体积，能通过predefine ROI from ALL template by selecting specific area 进行吗？还有用SPM算VBM得出的nii图像怎么用rest打开？总是提示要reslice,但是当用reslice功能时根本无法打开SPM得出的nii图像？请问这该怎么解决呢？ 我的目的是把一组被试的纹状体体积提取出来，然后与其某个脑区的ALFF值做相关。谢谢老师！ Forums:
restplus做图像翻转的问题
Submitted by Rhadamanthus on Wed, 03/16/2016 - 10:28
restplus在做图像翻转时会出现文件格式发生改变和文件大小翻倍的情况，比如单个的240kb的.img文件在用完flip后会变成480kb的.nii文件，而且在做组翻转时，比如240个.img文件，每个文件大小都是240kb，flip后，虽然文件格式没发生变化，但是每个.img都变成了480kb,这个问题该如何解决？
3D ASL数据分析问题
Submitted by xusihua80 on Tue, 03/15/2016 - 10:50
各位好 我在Upenn神经成像中心的磁共振机器上扫完ASL之后生成的3DASL数据只有两个：一个mean*3D图像文件和一个mean*dat文件，跟restplus中3D ASL normalzie的help里提到的有cbf.nii和pfefmo.nii似乎不同， 在外人的帮助下，我们将这个mean图像转换生成了60个f*.nii文件和另外三个文件(M000.nii, M002.nii, meanperf.nii)，似乎跟王泽老师的ASLtbx里差异比较大，如果用restplus分析，接下来该怎么做呢？谢谢！ Forums:
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