计算ReHo结果中VOXEL数目
大家好:
有没有好的方法或者软件包能计算一个cluster中灰质voxel的数目?或者有能用的程序段吗?
这个问题对我们的北京比较恼火 谢谢大家啦
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大家好:
有没有好的方法或者软件包能计算一个cluster中灰质voxel的数目?或者有能用的程序段吗?
这个问题对我们的北京比较恼火 谢谢大家啦
严老师:你好,我是用dparsf预处理的数据,rest 做的统计分析,现在统计的图片和cl report都出来了,就是不太明白如何整理cl report中的结果,生成发表文章的报表形式,我做的是癫痫患者和病人的双样本T检验,MASK是并集MASK,做过AlphaSim 校正,增强的Clusters 有26个,减弱的有15个,这些体素都要报告吗,是不是有点多啊?
还有每个Peak点对应的脑区该如何选择啊,是选择voxel structures 中较大的相对具体的脑区,还是peak MNI coordinate 中的比较具体的脑区,如果两者不一致的情况下该如何选择,有几个差不多大的较大的脑区是都要报告出来吗?
还有一个问题不明白,不是经过AlphaSim(>55个体素)校正了吗,为什么活下来的clusters中还有很多是小于55的也在cl reports中显示出来了啊?
论坛老师好!
我用REST的Correlation ananlysis,voxel wise做功能图像与临床的相关,Groop image中input图像,seed variate中input临床因子的txt文档。
刚刚综述完ReHo的文章,发现似乎在two-sample t中,很少有FWE校正的结果,有一下几个问题:
1.对于two-sample t,很少有文章报道FWE校正的结果,请问这是为什么?是ReHo算法本身使得导致的还是数据一致性不高导致的?
2. 有没有人发现FWE校正后仍然有结果survive出现的情况?
3. 如果在全脑范围内没有FWE校正的结果,能不能在有差异的区域之内利用FWE采取small volume correction进行校正呢?
谢谢
Hi Everyone
I'm new to REST and DPARSF. So far, the setup worked very well, but when it came to Detrending the data, Matlab gave my an out of memory error. What kind of solutions are there?
Thanks a lot for any hints!
Eugenio
Didn't get a reply so re-posting the below message. It is now happening for multiple data sets so I would be very grateful for some suggestions...
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Hello,
老師
要如何把影像的亮度調平均值
例如可以每個病人的影像都可以normalise到0-100
謝謝老師
老师您好,我是初学fMRI的,目前遇到的问题是:当我运行DPARSF basic edition处理从您的网站提供的联系数据的时候,勾选好选项点击RUN就直接出现下面的代码,当运行advanced edition的时候就不会出现,请问这是什么情况?谢谢!
??? Reference to non-existent field 'FunctionalSessionNumber'.
Error in ==> DPARSF_run at 240
for iFunSession=1:AutoDataProcessParameter.FunctionalSessionNumber
Error in ==> DPARSF>pushbuttonRun_Callback at 989
[Error]=DPARSF_run(handles.Cfg);
大家好:
大家好 我的问题还是关于Voxel size的。我看到有人得表格里面报道Voxel Size,也有Voxels Number,
1. 后者很好理解,但是前者是不是(Voxel Number*重切后单个体素的体积大小)得到的数值?
2.怎么能得到准确的Voxel Number呢?
我以前的师兄是用自己编写的程序提取一定T值之上的体素的坐标,转换成TALARAICH,然后利用一个软件计算出来,最后剔除白质/CSF/非脑区后剩下的,但是我觉得这个方法不准确(感觉而已)。
大家有什么好的推荐吗?