tomowillco用户你好：
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Firstly, all the images  should be corrected with the “eddy- current” toolbox in FSL.

臧老师好，reviewer提出使用T1图像做协变量前，需要用FSL做这个步骤？呃，我手头没有FSL软件，有啥可以替代的么？

ｒｅｖｉｅｗｅｒ提问，为啥一定是４４４的平滑？

我查了下，似乎有地方提出，平滑核的选择应该是ｖｏｘｅｌ的１.５倍数，ｖｏｘｅｌ是３３３，那么应该是４.５？

各位前辈好！

      我现在做了一个两样本t检验，打算在rest里面使用alphasim来估计cluster size，首先需要估计平滑核，具体界面见附件。里面需要输入三个文件才能估计平滑核，其中中间的mask file是做两样本t检验的mask吗？那其余的input statistical map和 FWHM of statistical map需要输入什么呢？

      谢谢各位！

    rest 里面的extract ROI Signal功能，我用自己弄的90个脑区作为ROI，最后得到的resultCorr.txt（90*90矩阵），是90个脑区的相关系数，接着去除了这90个脑区的协变量，再做了功能连接之后的ROI-WISE也得到FCMap.txt 或zFCMap.txt（90*90矩阵）,这个也是90个脑区相关系数。

北师大心理学院的11212015246新注册用户您好：你留的信箱可能是错误的，无法完成注册。请与我联系。zangyf@gmail.com

（新手）我有三组数据要进行分析，下面是我尝试的分析处理过程，但是不知道对不对，求老师指导一下，谢谢！

利用rest首先进行的ANOVA，找到差异性显著的clusters，（不知如何选择ROI做mask，所以只是单纯的存为clusterA.txt）。然后进行two sample t-test，又出来一些差异性显著的clusters，3组每进行两两比较就得到3个这样的clusters，分别记为cluster1,2,3。然后我将clusterA中具体的cluster与cluster1,2,3中的进行比对，将能对应起来的看作是两两比较时有差异性的脑区。这样做对吗？如果不对的话，麻烦教一下正确的方法。

另外，在rest中如何将ALFF voxel转换成 ALFF value？ 用ALFF与行为学指标做相关是需要ALFF value吗？不是的话，那又该怎么做呢？

各位好：

         我研究的是中风病人和正常人ICA网络的组间差异问题，拿运动网络为例，我们发现病人组和正常人组的单样本图差异很大（前提是卡了同一个阈值），主要是涉及的脑区范围存在显著差异，正常人组单样本图比较正常，病人组的单样本图明显比正常人组小了好几圈，为了定量表征两组间这种差异，体素个数上的差异（或者说网络覆盖程度的差异），我具体的应该怎样统计呢？我的预想是将每个被试的运动网络的map的体素个数输出来，然后对正常人和病人进行双样本T检验，但是，问题是，我在想每个个体的map在计数前得先卡个阈值，可是卡多大呢？还有是在全脑内计数，还是在一个motor网络的mask内计数呢？而这个mask我选择什么呢？

        希望表达清楚了，望老师能帮菜鸟指点，万分感谢！