GRF校正的疑惑

老师好,我投出去的ALFF的文章被拒了,一个reviewer说不太愿意接受alphasim的校正,如果要有,至少要clusters在100-200才可以接受。
我用FDR做了,没有结果。
但是用rest推荐的GRF的结果做出来的却非常不错,比alphasim的cluster大好多,每个cluster都在100以上了。
但是我有点疑问,是不是GRF的校正使用不太普遍? 我看到网上的文章大多使用alphasim或者FDR和FWE,GRF似乎只有不多的几篇。

GRF是可以被普遍接受的校正方法么?

请问REST里面的Image Calculator可以计算一张图像的平均值吗?

① REST image calculator可以计算一组图像的平均图像(mean(g1)),请问怎么计算一张图像的平均值吗?

② REST可以将一张T图转换成Z-score图吗?( i-mean(g1))/std(g1)这个计算的是i1相对于一组图的z-score图?如果我想把一个双样本t检验的T图转成Z图,请问怎么转?

谢谢老师!

对fmri数据怎么用FSL完成field map矫正?

静息态功能磁共振影像方法与应用培训班(REST南宁1610)

主办单位:
 
广西南宁灵康赛诺科生物科技有限公司
 
 
讲师单位:
 
杭州师范大学认知与脑疾病研究中心
 
中国科学院心理研究所
 
北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室
 
首都医科大学宣武医院
 
 
 
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使用dparsf for monkey 版本处理猴子的脑数据,如何进行reorient

老师,您好!

我目前正在使用dparsf 4.0 for monkey data 版本处理静息态猴子脑数据,采用的参数设置如下(事先已经去除了前6个时间点):

图1 参数设置

 

关于dpabi进行alphasim报错

各位老师,大家好,我现在在使用dpabi进行alphasim校正的时候遇到一个问题,希望老师能予以解答。

基本信息如下:我将VBM处理之后的SPMT图导入之后,选择重采样之后的mask文件,估计了平滑核等参数,然后iteration选择默认的1000,p选择了0.05,出现如下报错信息,如果p为0.01的话则可以顺利进行。

还有一个问题就是,在这种情况下,可以不可以使用p为0.01的这个文件看p为0.05的时候的voxels填入xjview等软件进行结果的查看?

用rest做统计分析

你好!看到有人用rest做统计分析时,先做两组被试的单样本T检验,得到的显著区域做并集mask,在这个mask下进行双样本T检验。如果是在全脑做的双样本T检验,rest只产生一个T图,那么在做alphasim较正的时候,估计平滑核用什么mask呢,下面的mask要用AAL模板吗?可是有人说估计平滑核的mask和下面的mask要用相同的,用spm可以产生mask,但是rest没有生成相关文件该怎么办呢?谢谢!

How to edit AAL template region

Hi all,

I have a quick question and I was hoping somebody might be able to help me. I have an a priori hypothesis about the involvement of Wernicke's area in a group of patients, and would like to use the AAL template regions to create an ROI. The AAL regions for middle temporal gyrus and superior temporal gyrus both span the entire length of the gyrus from anterior to posterior, but I was wondering if there is a way to isolate or edit the region to only look at the posterior third of the gyri. I have been looking online but haven't found any specific advice.